viernes, 14 de junio de 2013

Cuestiones (con solución) sobre lípidos (II)


1.- De la hidrólisis de la esfingomielina, ¿se produce colina?
2.- Identifica las siguientes moléculas.
      2.1.
 







     2.2.


2.3.











2.4.








3.- ¿Poseen fósforo los glucoesfingolípidos?, ¿y los glicerofosfolípidos?
4.- ¿Cuántos átomos de carbono presenta un sesquiterpeno?
5.- Indique tres características de la estructura general de una prostaglandina.
6.- ¿Qué tipo de enlace une un grupo fosfato con un grupo hidroxilo de una molécula de glicerol?


1.- Sí.
2.
   2.1. Esfingolípido.
   2.2. 1,2-Ciclopentanofenantreno (núcleo de los esteroides).
   2.3. Ácido fosfatídico.
   2.4. Cera
3. No
    Sí
4. 15
5. a) Anillo de ciclopentano b) Dos cadenas laterales largas en posición trans una con respecto a la otra. c) Ácido carboxílico en un extremo de una de las cadenas laterales.
6. Enlace fosfodiéster.

Cuestiones sobre glúcidos y glicobiología (II)

1. ¿Cómo actúa la invertasa sobre la sacarosa?
2. ¿Qué son las glicanas?
3. ¿En qué se diferencian la maltosa y la celobiosa?
4. ¿Cuál es el homopolímero de la D-glucopiranosa con función estructural en las plantas? ¿cuál es el producto de su hidrólisis?
5. ¿Cuáles son las glucanas del almidón? ¿cuál de ellas es ramificada? ¿cada cuantas moléculas de glucosa aparecen las ramificaciones? ¿qué enlace las une a la cadena principal?
6. En un glicoconjugado, ¿quién es el portador de la información? ¿qué utilidad tiene esta información?
7. ¿En qué estructura es mayor la proporción glucídica: en los proteoglicanos o en las glicoproteínas?
8. En las glicoproteínas, ¿cómo puede ser enlace glúcido-aminoácido? Pon un ejemplo de cada tipo.
9. ¿Qué presentan todos los oligosacáridos con unión N-glicosídica con la proteína?
10. ¿Cómo están constituidas las proteoglicanas?
...
...
...

1. Se produce la hidrólisis del disacárido, con la formación de la glucopiranosa con la configuración alpha y beta así como la glucofuranosa con configuraciones alpha y beta. 
2. Biopolímeros de monosacáridos unidos por enlaces glicosídicos. Polisacáridos. 
3. La unidad de glucosa no reductora de la maltosa tiene configuración alpha, mientras que la de la celobiosa tiene configuración beta. 
4. Celulosa. La celobiosa es el producto de la hidrólisis de la celulosa. 
5. Amilosa (lineal) y amilopectina (ramificada cada 20 o 30 unidades de glucosa, unidas por enlaces alpha-1,6').
6. El glúcido. Los polisacáridos y oligosacáridos son transportadores de información para a) el reconocimiento y adhesión intercelular, b) la migración celular y c) la respuesta inmunitaria.
7. En los proteoglicanos.
8. Unión O-glicosídica, como GalNAc-Ser, o N-glicosídica, como GlcNAc-Asn.
9. Un núcleo pentasacarídico común de dos unidades de GlcNAc y tres de manosa.
10. Las proteoglicanas están constituidas por cadenas de glicosaminoglicanos unidos covalentemente a una proteína. 

Cuestiones sobre aminoácidos, péptidos y proteínas (II)

1. Etapas principales de la síntesis de péptidos en solución.
2. Etapas principales de la síntesis de péptidos en fase sólida.
3. ¿Qué determina la estructura primaria de una proteína?
4. ¿Qué proteínas son insolubles en agua: las fibrosas o las globulares?
5. A excepción de la estructura primaria, ¿qué tipo de interacciones mantienen los diferentes niveles estructurales de las proteínas?
6. Indica tres factores que afecten a la estructura de una alpha-hélice.


1.
    a) Protección del grupo amino del aa N-terminal en forma de carbamato, haciéndolo no nucleófilo.
    b) Activación del grupo carboxilo con cloroformiato de etilo. Se forma un anhidrido mixto.
    c) Adición del segundo aminoácido (no protegido)
    d) Desprotección del extremo N-terminal sin que se afecte el enlace peptídico.
2.
    a) Protección del grupo amino del aa C-terminal en forma de carbamato, haciéndolo no nucleófilo.
    b) Anclaje del primer aminoácido por su extremo C-terminal a la resina (SN2, formación de un éster).
    c) Liberación el grupo amino anclado a la resina.
    d) Adición del segundo aminoácido protegido en su extremo N-terminal, con un agente de acoplamiento (diciclohexilcarbodiimida). Se forma diciclohexil urea.
    e) En una última etapa, desprotección del extremo N-terminal y desanclaje de la resina con HF.
3. La secuencia de aminoácidos y la formación de puentes disulfuro.
4. Las fibrosas.
5. Interacciones débiles: solvatación, enlaces de hidrógeno o fuerzas de Van der Waals.
6. a) Presencia de residuos de prolina (no pueden formar puentes de hidrógeno).
      b) Repulsión electrostática debido a la proximidad de grupos con la misma carga eléctrica.
      c) Presencia de grupos voluminosos.

Cuestiones sobre aminoácidos, péptidos y proteínas

1. Nombre lo siguientes compuestos:
  a) Fmoc
  b) Boc
  c) Cbz
¿Cuál de ellos no se puede utilizar en la síntesis de péptidos en fase sólida para proteger al grupo amino?
2. Indique las etapas principales de cuatro métodos de síntesis de aminoácidos.
3. ¿Qué alpha-aminoácido proteinogénico no es quiral?
4. ¿Puede formar puentes de hidrógeno la prolina? ¿en qué proteína es abundante este aa?
5. ¿Qué configuración tiene la L-Cys?
6. En la síntesis de péptidos en disolución se parte del extremo ...(a)... terminal, mientras que en la síntesis de péptidos en fase sólida se parte del extremo ...(b).. terminal.
7. ¿Qué tipo de aa absorbe característicamente la luz ultravioleta a 280 nm?
8. Ordena los aa cargados positivamente en su cadena lateral en orden creciente de basicidad.
9. ¿En qué consiste la electroforesis de aminoácidos? ¿qué utilidades tiene?
10. La síntesis química de aminoácidos conduce a mezclas racémicas de las que hay que separar el isómero L, ¿qué métodos existen para dicha separación?

...
...
...

1. a) Fluorenilmetiloxicarbonil
    b)
    c) Benciloxicarbonilo

2. Aminación reductiva.
        a) Tratamos el alpha-cetoácido con exceso de amoníaco.
        b) Reducimos la imina formada con hidrógeno en catalizador de Pt.
    Aminación de un alfa-aminoácido
        a) Bromamos con HVZ la posición alpha de un ácido carboxílico.
        b) Sustituimos el halógeno con exceso de amoniaco.
    Combinación de síntesis de Gabriel con síntesis malónica
        a) Alquilación del éster ftalimidomalónico.
        b) Por hidrólisis ácida rompemos los enlaces imida y los grupos éster los convertimos en ácido.
        c) Por calentamiento, descarboxilamos un grupo carboxilo.
    Síntesis de Strecker
        a) El aldehído reacciona con el amoniaco para dar una imina que se protona.
        b) La imina sufre la adición nucleófila del ion cianuro.
        c) El alpha-aminonitrilo obtenido se hidroliza en medio ácido.
3. Glicina
4. No. En el colágeno.
5. (R)
6. a) N b) C
7. Los aromáticos: Phe, Tyr y Trp.
8. His< Lys< Arg
9. Consiste en la aplicación de un campo eléctrico a una disolución tamponada donde se sumerge una placa sobre la que se deposita una mezcla de aminoácidos. Permite estimar: el número de proteínas, grado de pureza, masa molecular aproximada y punto isoeléctrico.
10. Cristalización fraccionada, cromatografía quiral o resolución enzimática.

Cuestiones sobre glúcidos y glicobiología

1. ¿Cómo se llaman los acetales en el carbono anomérico de los carbohidratos? ¿son reductores?
2. Indica tres disacáridos con enlaces 1,4'
3. ¿Qué unidades forman la sacarosa? ¿qué tipo de enlaces las une?
4. Indica tres funciones de los carbohidratos.
5. ¿Cómo se llaman los polímeros glucídicos unidos covalentemente a proteínas o lípidos?
6. ¿Cómo actúa el agua bromada sobre un monosacárido?
7. ¿Cuál es el reactivo de Tollens? ¿cómo actúa sobre una aldosa?
8. ¿Qué reactivo se puede utilizar para oxidar un monosacárido hasta ácido aldárico?
9. ¿Cómo se puede obtener un alditol?
10. ¿Cómo se llaman los carbohidratos en los que el hidroxilo anomérico se ha reemplazado por un grupo amino? Ponga un ejemplo.
11. ¿Cómo se llaman los carbohidratos en los que un hidroxilo no anomérico se ha reemplazado por un grupo amino? Ponga un ejemplo.
12. ¿Cuáles son los nombres desarrollados de GlcNAc y GalNAc? ¿qué tipo de carbohidrato son?
13. El enlace O-glicosídico que une dos monosacáridos, ¿es estable a la hidrólisis básica o ácida?

...
...
...
...

1. Glicósidos. No son reductores.
2. Celobiosa, lactosa y maltosa
3. Fructosa y sacarosa. Enlace 1,1'.
4. a) Fuente de energía primaria, b) elementos estructurales y de protección y c) reconocimiento y adhesión celular.
5. Glicoconjugados.
6. Oxida selectivamente el grupo aldehído de una aldosa a ácido carboxílico, sin que se oxiden los grupos hidroxilos ni el carbonilo de las cetosas.
7. Diaminplata. Oxida al grupo aldehído para dar lugar a un ácido aldónico.
8. Ácido nítrico.
9. Por reducción con borohidruro de sodio en agua, o por tratamiento con hidrógeno y Pd, a partir de una aldosa o cetosa.
10. Glicosilaminas. Beta-D-glucopiranosilamina.
11. Aminoazúcares. Beta-D-glucosamina.
12. GlcNAc = N-Acetilglucosamina. GalNAc = N-Acetilgalactosamina. Ambos son aminoazúcares.
13. El enlace O-glicosídico es estable a la hidrólisis básica. En cambio, se hidroliza en presencia de ácido diluido.